MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012804	TG	3	6	335	340	0 %	50 %	50 %	0 %	240102059
2	NC_012804	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102059
3	NC_012804	TGA	3	9	414	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102059
4	NC_012804	GT	3	6	425	430	0 %	50 %	50 %	0 %	240102059
5	NC_012804	TGA	2	6	435	440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102059
6	NC_012804	ATT	2	6	472	477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102059
7	NC_012804	TCA	2	6	495	500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102059
8	NC_012804	GAA	2	6	516	521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102059
9	NC_012804	GAG	2	6	580	585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102059
10	NC_012804	GAA	2	6	591	596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102059
11	NC_012804	AAG	2	6	718	723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102059
12	NC_012804	CTT	2	6	729	734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102059
13	NC_012804	TAC	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102059
14	NC_012804	TAT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102059
15	NC_012804	AG	3	6	838	843	50 %	0 %	50 %	0 %	240102059
16	NC_012804	TAC	2	6	874	879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102059
17	NC_012804	T	7	7	906	912	0 %	100 %	0 %	0 %	240102059
18	NC_012804	AG	3	6	967	972	50 %	0 %	50 %	0 %	240102059
19	NC_012804	GAA	2	6	1020	1025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102059
20	NC_012804	GAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102059
21	NC_012804	GGA	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102059
22	NC_012804	GT	3	6	1144	1149	0 %	50 %	50 %	0 %	240102059
23	NC_012804	ATG	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102059
24	NC_012804	GAA	2	6	1167	1172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102059
25	NC_012804	GGA	2	6	1290	1295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102059
26	NC_012804	AGG	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102059
27	NC_012804	TGA	2	6	1431	1436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102059
28	NC_012804	ACT	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102059
29	NC_012804	TTA	3	9	1467	1475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102059
30	NC_012804	ATT	2	6	1482	1487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102059
31	NC_012804	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102059
32	NC_012804	TA	3	6	1524	1529	50 %	50 %	0 %	0 %	240102059
33	NC_012804	A	6	6	1536	1541	100 %	0 %	0 %	0 %	240102059
34	NC_012804	AAG	2	6	1590	1595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102059
35	NC_012804	GA	3	6	1635	1640	50 %	0 %	50 %	0 %	240102059
36	NC_012804	A	6	6	1684	1689	100 %	0 %	0 %	0 %	240102059
37	NC_012804	ATG	2	6	1697	1702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102059
38	NC_012804	AAT	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102059
39	NC_012804	TTG	2	6	1811	1816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102059
40	NC_012804	AT	3	6	1869	1874	50 %	50 %	0 %	0 %	240102059
41	NC_012804	TAGA	2	8	1916	1923	50 %	25 %	25 %	0 %	240102059
42	NC_012804	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102059
43	NC_012804	A	6	6	1981	1986	100 %	0 %	0 %	0 %	240102059
44	NC_012804	ATT	2	6	1999	2004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102059
45	NC_012804	A	7	7	2020	2026	100 %	0 %	0 %	0 %	240102059
46	NC_012804	ATTGGA	2	12	2033	2044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102059
47	NC_012804	A	6	6	2044	2049	100 %	0 %	0 %	0 %	240102059
48	NC_012804	CAT	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102059
49	NC_012804	AT	3	6	2093	2098	50 %	50 %	0 %	0 %	240102059
50	NC_012804	GTT	2	6	2122	2127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102059
51	NC_012804	AG	3	6	2176	2181	50 %	0 %	50 %	0 %	240102059
52	NC_012804	TAC	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102060
53	NC_012804	AAG	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102060
54	NC_012804	AGC	2	6	2293	2298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102060
55	NC_012804	TTA	2	6	2382	2387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102060
56	NC_012804	GTTGGA	2	12	2413	2424	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	240102060
57	NC_012804	TTA	2	6	2460	2465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102060
58	NC_012804	TCT	2	6	2470	2475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102060
59	NC_012804	AAT	2	6	2495	2500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102060
60	NC_012804	AT	3	6	2510	2515	50 %	50 %	0 %	0 %	240102060
61	NC_012804	GGT	2	6	2553	2558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102060
62	NC_012804	A	6	6	2566	2571	100 %	0 %	0 %	0 %	240102060
63	NC_012804	AAT	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102060
64	NC_012804	AAG	2	6	2743	2748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102060
65	NC_012804	GTG	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102060
66	NC_012804	ATAA	2	8	2762	2769	75 %	25 %	0 %	0 %	240102060
67	NC_012804	TTTAAT	2	12	2782	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102060
68	NC_012804	CT	3	6	2839	2844	0 %	50 %	0 %	50 %	240102060
69	NC_012804	A	7	7	2854	2860	100 %	0 %	0 %	0 %	240102060
70	NC_012804	AAT	2	6	2884	2889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102060
71	NC_012804	GACA	2	8	2938	2945	50 %	0 %	25 %	25 %	240102060
72	NC_012804	TAT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102060
73	NC_012804	AAATT	2	10	3120	3129	60 %	40 %	0 %	0 %	240102060
74	NC_012804	AAAC	2	8	3137	3144	75 %	0 %	0 %	25 %	240102060
75	NC_012804	TTGA	2	8	3206	3213	25 %	50 %	25 %	0 %	240102060
76	NC_012804	A	7	7	3230	3236	100 %	0 %	0 %	0 %	240102060
77	NC_012804	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102060
78	NC_012804	A	8	8	3291	3298	100 %	0 %	0 %	0 %	240102060
79	NC_012804	GGA	2	6	3322	3327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102060
80	NC_012804	AAT	2	6	3363	3368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102061
81	NC_012804	TACT	2	8	3388	3395	25 %	50 %	0 %	25 %	240102061
82	NC_012804	ATA	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102061
83	NC_012804	CTAT	2	8	3428	3435	25 %	50 %	0 %	25 %	240102061
84	NC_012804	TGG	2	6	3470	3475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102061
85	NC_012804	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102061
86	NC_012804	GAAA	2	8	3544	3551	75 %	0 %	25 %	0 %	240102061
87	NC_012804	A	6	6	3549	3554	100 %	0 %	0 %	0 %	240102061
88	NC_012804	AGA	2	6	3580	3585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102061
89	NC_012804	T	6	6	3598	3603	0 %	100 %	0 %	0 %	240102061
90	NC_012804	TAT	2	6	3658	3663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102061
91	NC_012804	TAT	2	6	3687	3692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102061
92	NC_012804	TC	3	6	3708	3713	0 %	50 %	0 %	50 %	240102061
93	NC_012804	AAC	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102061
94	NC_012804	AT	3	6	3830	3835	50 %	50 %	0 %	0 %	240102061
95	NC_012804	CCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102061
96	NC_012804	TAC	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102061
97	NC_012804	AT	3	6	3917	3922	50 %	50 %	0 %	0 %	240102061
98	NC_012804	AT	3	6	3939	3944	50 %	50 %	0 %	0 %	240102061
99	NC_012804	TTC	2	6	3980	3985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102061
100	NC_012804	AT	3	6	4015	4020	50 %	50 %	0 %	0 %	240102061
101	NC_012804	T	6	6	4020	4025	0 %	100 %	0 %	0 %	240102061
102	NC_012804	A	6	6	4041	4046	100 %	0 %	0 %	0 %	240102061
103	NC_012804	AGA	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102061
104	NC_012804	ATC	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102061
105	NC_012804	T	7	7	4072	4078	0 %	100 %	0 %	0 %	240102061
106	NC_012804	TTATA	2	10	4089	4098	40 %	60 %	0 %	0 %	240102061
107	NC_012804	ACTT	2	8	4111	4118	25 %	50 %	0 %	25 %	240102061
108	NC_012804	AG	3	6	4174	4179	50 %	0 %	50 %	0 %	240102061
109	NC_012804	TATAAG	2	12	4195	4206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	240102061
110	NC_012804	GT	3	6	4226	4231	0 %	50 %	50 %	0 %	240102061
111	NC_012804	GTT	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102061
112	NC_012804	TAG	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102061
113	NC_012804	TTA	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102061
114	NC_012804	TTTA	2	8	4359	4366	25 %	75 %	0 %	0 %	240102061
115	NC_012804	ATT	2	6	4431	4436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102061
116	NC_012804	AT	3	6	4460	4465	50 %	50 %	0 %	0 %	240102061
117	NC_012804	TTTC	2	8	4482	4489	0 %	75 %	0 %	25 %	240102061
118	NC_012804	CTT	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102061
119	NC_012804	ATGT	2	8	4612	4619	25 %	50 %	25 %	0 %	240102061
120	NC_012804	ATT	2	6	4680	4685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102061
121	NC_012804	TTA	2	6	4751	4756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102061
122	NC_012804	AAG	2	6	4757	4762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102061
123	NC_012804	ACA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102061
124	NC_012804	GTT	2	6	4807	4812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102061
125	NC_012804	CAA	2	6	4899	4904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102061
126	NC_012804	AGA	2	6	4905	4910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102061
127	NC_012804	ATT	2	6	4930	4935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102061
128	NC_012804	TAT	2	6	4972	4977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102061
129	NC_012804	T	6	6	4987	4992	0 %	100 %	0 %	0 %	240102061
130	NC_012804	TTA	2	6	5037	5042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102061
131	NC_012804	AGA	2	6	5109	5114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102061
132	NC_012804	T	6	6	5116	5121	0 %	100 %	0 %	0 %	240102061
133	NC_012804	TAA	2	6	5186	5191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102061
134	NC_012804	A	6	6	5213	5218	100 %	0 %	0 %	0 %	240102061
135	NC_012804	AT	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	240102061
136	NC_012804	AT	3	6	5246	5251	50 %	50 %	0 %	0 %	240102061
137	NC_012804	CT	3	6	5660	5665	0 %	50 %	0 %	50 %	240102062
138	NC_012804	CATA	2	8	5667	5674	50 %	25 %	0 %	25 %	240102062
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269	NC_012804	CTGG	2	8	11919	11926	0 %	25 %	50 %	25 %	240102068
270	NC_012804	CTT	2	6	11934	11939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102068
271	NC_012804	CTA	2	6	11981	11986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102068
272	NC_012804	GCG	2	6	12013	12018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102068
273	NC_012804	GA	3	6	12042	12047	50 %	0 %	50 %	0 %	240102068
274	NC_012804	GAA	2	6	12150	12155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102068
275	NC_012804	GA	3	6	12178	12183	50 %	0 %	50 %	0 %	240102068
276	NC_012804	GAA	2	6	12215	12220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102068
277	NC_012804	GCT	2	6	12383	12388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102068
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279	NC_012804	TGA	2	6	12452	12457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102068
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281	NC_012804	ATT	2	6	12601	12606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102068
282	NC_012804	AAC	2	6	12798	12803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102068
283	NC_012804	ATC	2	6	12804	12809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102068
284	NC_012804	AGG	2	6	12810	12815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102068
285	NC_012804	GGC	2	6	12860	12865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102068
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289	NC_012804	GAAAG	2	10	13062	13071	60 %	0 %	40 %	0 %	240102068
290	NC_012804	CTG	2	6	13074	13079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102068
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295	NC_012804	GGA	2	6	13248	13253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102069
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303	NC_012804	CTC	2	6	13577	13582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102069
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393	NC_012804	AT	3	6	18195	18200	50 %	50 %	0 %	0 %	240102071
394	NC_012804	CCT	2	6	18268	18273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102072
395	NC_012804	AGC	2	6	18278	18283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102072
396	NC_012804	AAC	2	6	18307	18312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102072
397	NC_012804	GAA	2	6	18325	18330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102072
398	NC_012804	GTA	2	6	18358	18363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102072
399	NC_012804	TTG	2	6	18486	18491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102072
400	NC_012804	TCCA	2	8	18681	18688	25 %	25 %	0 %	50 %	240102072
401	NC_012804	CGT	2	6	18697	18702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102072
402	NC_012804	CT	3	6	18714	18719	0 %	50 %	0 %	50 %	240102072
403	NC_012804	TTA	2	6	18807	18812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102072
404	NC_012804	CT	3	6	18825	18830	0 %	50 %	0 %	50 %	240102072
405	NC_012804	CCT	2	6	18869	18874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102072
406	NC_012804	TTAT	2	8	18878	18885	25 %	75 %	0 %	0 %	240102072
407	NC_012804	TGA	2	6	19118	19123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102072
408	NC_012804	T	6	6	19180	19185	0 %	100 %	0 %	0 %	240102072
409	NC_012804	TCC	2	6	19209	19214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102072
410	NC_012804	CTT	2	6	19451	19456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102073
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412	NC_012804	GA	3	6	19515	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	240102073
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417	NC_012804	ACA	2	6	20022	20027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102073
418	NC_012804	TCC	2	6	20173	20178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102073
419	NC_012804	CAAC	2	8	20189	20196	50 %	0 %	0 %	50 %	240102073
420	NC_012804	CCGC	2	8	20205	20212	0 %	0 %	25 %	75 %	240102073
421	NC_012804	CCG	2	6	20345	20350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102074
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425	NC_012804	TTC	2	6	20452	20457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102074
426	NC_012804	CCA	2	6	20540	20545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102074
427	NC_012804	CCCT	2	8	20554	20561	0 %	25 %	0 %	75 %	240102074
428	NC_012804	GAA	2	6	20570	20575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102074
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431	NC_012804	TC	3	6	20688	20693	0 %	50 %	0 %	50 %	240102074
432	NC_012804	CGC	2	6	20699	20704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102074
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436	NC_012804	CGG	2	6	20829	20834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102074
437	NC_012804	AAC	2	6	20871	20876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102074
438	NC_012804	GCTC	2	8	20962	20969	0 %	25 %	25 %	50 %	240102074
439	NC_012804	CCA	2	6	21009	21014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102074
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441	NC_012804	AGA	2	6	21086	21091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102074
442	NC_012804	ACC	2	6	21116	21121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102074
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445	NC_012804	TCCC	2	8	21261	21268	0 %	25 %	0 %	75 %	240102074
446	NC_012804	AGCC	2	8	21306	21313	25 %	0 %	25 %	50 %	240102074
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456	NC_012804	GAG	2	6	21832	21837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102075
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464	NC_012804	CTC	2	6	22150	22155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102075
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494	NC_012804	CCT	2	6	24140	24145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102077
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497	NC_012804	GGCG	2	8	24218	24225	0 %	0 %	75 %	25 %	240102077
498	NC_012804	GAA	2	6	24381	24386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102077
499	NC_012804	A	6	6	24385	24390	100 %	0 %	0 %	0 %	240102077
500	NC_012804	TGAAGC	2	12	24394	24405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240102077

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